4月26日,國家衛健委舉辦全國視頻會(huì )議,明確提出“所有縣區級以上疾控機構、二級以上綜合醫院要抓緊進(jìn)行改造,在短時(shí)間內形成核酸檢測能力”。
各地的公立機構檢測能力不能滿(mǎn)足需求只是暫時(shí)的,獨立醫學(xué)實(shí)驗室在充實(shí)檢測力量的同時(shí),發(fā)揮自己豐富的檢驗管理運營(yíng)理念,以及區域化覆蓋的經(jīng)驗優(yōu)勢,融入到“國家隊”核酸檢測能力的建設中,順勢而為,乘勢而上。
隨著(zhù)各地都在建立PCR實(shí)驗室,本文從硬件基礎的角度,梳理了PCR實(shí)驗室建設的幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn),獨立醫學(xué)實(shí)驗室可以運用豐富的運營(yíng)經(jīng)驗,進(jìn)行建設指導、人員梯隊建立、質(zhì)控體系搭建、區域化服務(wù)支持等。
如何建設PCR實(shí)驗室
與PCR實(shí)驗室建設相關(guān)的指導文件主要有四份:
《醫療機構管理條例》
《醫療機構臨床實(shí)驗室管理辦法》
《臨床基因擴增檢驗實(shí)驗室管理暫行辦法》
《醫療機構臨床基因擴增實(shí)驗室管理辦法》
要求臨床PCR實(shí)驗室,不但在實(shí)驗室設置及儀器設備等硬件上要滿(mǎn)足開(kāi)展臨床檢驗的條件,而且要求實(shí)驗室在日常工作要有文件化的工作程序。
下面就在PCR實(shí)驗室建設過(guò)程中的幾個(gè)關(guān)鍵控制點(diǎn)進(jìn)行闡述:
根據實(shí)驗室的具體情況編寫(xiě)質(zhì)量體系文件,《質(zhì)量手冊》、《程序文件》、《作業(yè)指導書(shū)》,并保證管理體系運行有效。
管理體系的特點(diǎn)是應有明確的目的、規范的管理、有效的制約、高效的機制、能自我發(fā)展的整體。
建立完善的SOP文件,對完成各項質(zhì)量活動(dòng)的方法作出規定,每個(gè)SOP都應對一個(gè)或一組相互關(guān)系的活動(dòng)進(jìn)行描述。
每個(gè)SOP文件應說(shuō)明該項質(zhì)量各環(huán)節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關(guān)活動(dòng)的接口關(guān)系。
明確每個(gè)環(huán)節轉換過(guò)程中各項因素的要求,即由誰(shuí)做、做什么、做到什么程序、達到什么要求,如何控制、形成什么記錄和報告,以及相應的審批手續。
規定在質(zhì)量活動(dòng)中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡(jiǎn)練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。
要完成一組PCR實(shí)驗,通常需要經(jīng)過(guò)試劑配制、樣品處理、核酸擴增和產(chǎn)物分析4個(gè)實(shí)驗過(guò)程。
這4個(gè)實(shí)驗過(guò)程的實(shí)驗用房應相鄰布置,組成一個(gè)獨立的PCR實(shí)驗區。標準的PCR實(shí)驗區包括:試劑準備區、標本制備區、擴增區、產(chǎn)物分析區、各區配套的緩沖區及公共走廊。
某醫院PCR實(shí)驗室平面布局如圖1所示,整個(gè)區域有一個(gè)公用走廊,每個(gè)獨立實(shí)驗區設有專(zhuān)門(mén)的緩沖區。通過(guò)壓差控制,使整個(gè)PCR實(shí)驗過(guò)程中試劑和標本免受氣溶膠的污染,并且降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。
圖表1、某醫院PCR實(shí)驗室平面圖
該實(shí)驗區主要進(jìn)行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。
試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區,不得經(jīng)過(guò)其他區域。試劑原材料必須貯存在本區內,并在本區內制備成所需的貯存試劑。
試劑準備區配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷負荷時(shí),需要將它們計算在內。
房間的面積宜控制在15m2~20m2。本區的壓力梯度要求為:相對正壓狀態(tài),以防止外界含核酸氣溶膠的空氣進(jìn)入,造成污染。
該區域主要進(jìn)行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時(shí)cDNA的合成。
標本制備區配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱,計算冷負荷時(shí),需要將它們計算在內。在標本制備區,還需要配備生物安全柜,用于進(jìn)行提取核酸的操作。
為避免提取的核酸在柜內反復循環(huán),造成標本之間的交叉污染,出現假陽(yáng)性結果,該區域配備的生物安全柜必須是B2型的。生物安全柜工作區垂直氣流全部來(lái)自實(shí)驗室,排風(fēng)經(jīng)過(guò)高效過(guò)濾器(www.rfilter.com)過(guò)濾后直接排至室外,不允許回到安全柜和實(shí)驗室中。
根據經(jīng)驗,如果實(shí)驗室內配備生物安全柜,每配備一臺,實(shí)驗室的面積增加10m2;標本制備區的面積宜在25m2~30m2之間。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為正壓,以避免從鄰近區進(jìn)入本區的氣溶膠污染。
該區域主要進(jìn)行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來(lái)自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來(lái)自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進(jìn)行。
在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開(kāi)反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區內進(jìn)行。
擴增室主要配備PCR實(shí)驗室的核心儀器PCR儀,本文實(shí)例中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。
在實(shí)驗室建造過(guò)程中,需要給PCR儀配備專(zhuān)門(mén)的UPS電源,以保證其正常工作。該區面積控制在15m2~20m2。
本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區內的不必要的走動(dòng)。個(gè)別操作如加樣等應在超凈臺內進(jìn)行。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實(shí)現。
該區域主要進(jìn)行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動(dòng)封閉分析儀器檢測,此區域可不設。
在室內配備通風(fēng)櫥,保證房間內的相對負壓,空氣從室外流向室內。該區面積控制在15m2~20m2。
本區是最主要的擴增產(chǎn)物污染來(lái)源,因此對本區的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區域為負壓,以避免擴增產(chǎn)物從本區擴散至其它區域。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實(shí)現。
根據壓力梯度的要求,試劑配制室和樣品處理室為相對正壓,擴增室和產(chǎn)物分析室為相對負壓,要求正壓的區域和要求負壓的區域的緩沖室內的壓力設計大不相同。
正壓緩沖室符合一般正壓潔凈室的緩沖原則,主要是防止室外環(huán)境空氣中的氣溶膠進(jìn)入室內。正壓緩沖室的布置如圖2所示。
圖表2、正壓緩沖室的布置圖
負壓緩沖室則是要求緩沖室對核酸擴增室及產(chǎn)物分析區保持正壓,對緩沖室外也保持正壓(主要是滿(mǎn)足室內凈化需要,如室內無(wú)潔凈要求,此處可以為0壓)。負壓緩沖室的布置如圖3所示。
圖表3、負壓緩沖室的布置圖
PCR實(shí)驗室設計的核心問(wèn)題是如何避免污染。在實(shí)際工作中,常見(jiàn)的有以下幾種污染類(lèi)型:擴增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。因此要避免污染,首先應是預防,而不是排除。
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工作區域的嚴格劃分,各個(gè)實(shí)驗區域要有明顯的標記(如醒目的門(mén)牌或不同的地面顏色等),以避免各個(gè)不同實(shí)驗區域設備物品、試劑等發(fā)生混淆。
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合理的系統設置,合理的空調通風(fēng)系統設置,盡量采用全送全排的空調系統;嚴格的氣流壓力控制,保證不同的實(shí)驗區內不同的壓力要求。
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規范的操作,臨床基因擴增檢驗實(shí)驗室的技術(shù)人員必須進(jìn)行上崗培訓,在實(shí)驗操作過(guò)程中,操作者必須戴手套,并經(jīng)常更換。清潔工作及時(shí)、正確。實(shí)驗工作結束后,必須立即對本區進(jìn)行清潔。
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嚴格的管理:嚴格控制進(jìn)出實(shí)驗室的人員。在各個(gè)實(shí)驗區域使用帶有明顯區別標志的工作服(如不同顏色),當工作人員離開(kāi)時(shí)不得將本區的工作服帶至其它區域;盡量減少在實(shí)驗區內不必要的走動(dòng)以減少交叉污染的可能性。擴增產(chǎn)物分析區是最主要的擴增產(chǎn)物污染來(lái)源,廢液不能在實(shí)驗室中傾倒,必須經(jīng)消毒液浸泡消毒后在遠離實(shí)驗室的地方棄掉,用過(guò)的吸頭等一次性材料也應經(jīng)消毒液浸泡消毒后統一處理,如焚燒等;